Ledige stillinger i Colorektal Cancer Gruppen

Colorektal cancer gruppens forskning har to overordnede målsætninger.
Størst og vigtigst er identifikation, udvikling og afprøvning af biomarkører associerede med relevante kliniske endepunkter (diagnostiske, prognostiske og prædiktive). Det andet mål er at forstå den biologiske betydning af de molekylære ændringer der opstår i forbindelse med transformationen fra normal tarmcelle til kræftcelle.
Molekylære markører kan bruges til at forudsige, hvordan det vil gå patienter i fremtiden. F.eks. i forbindelse med screening af ikke-symptomatiske patienter mhp. at identificere patienter med forstadier til kræft førend de giver kliniske symptomer. Identificeres sygdommen allerede i sådanne tidlige stadier, mangedobles patienternes chancer for at kunne kureres med kirurgi.
Hos patienter, der har fået konstateret kæft, skal biomarkørerne bl.a. anvendes til at forudsige, om de vil respondere på en eventuel onkologisk behandling eller ej. Samlet vil denne viden gøre det muligt, at skræddersy behandlingen efter den enkelte patients behov og risiko for tilbagefald af sygdommen.

Basis for stort set alle projekter i gruppen er vores store colorektal cancer biobank, som vi driver i samarbejde med Kirurgisk Afdeling P, Århus Sygehus. Biobanken indeholder i dag væv fra ca. 2000 patienter  og årligt tilføres væv fra omkring 250 nye patienter.
Da stort set alle former for molekylære forandringer potentielt set kan anvendes som markører, så har vi i laboratoriet udstyr (typiske microarray baseret) og ekspertise til high-throughput screening for mange forskellige typer af forandringer. Vi har projekter hvor fokus er på identifikation af epigenetiske (DNA methylering), genetiske (naturligt forekommende polymorfier og cancer specifikke genetiske forandringer), og transcriptionelle (mRNA, miRNA og alternativ splejsning) markører.

 
Aktuelt søger vi projektledere til to større projekter. Det ene omhandler tidlig detektion af colorektal cancer baseret på måling af miRNAer i blodprøver, og det andet drejer sig om identifikation af biomarkører der kan forudsige behandlingsrespons hos metastatiske colorektal cancer patienter der overvejes behandlet med kemoterapi (Xelox). 
Både personer med og uden erfaring i projektledelse opfordres til at søge. Afhængigt af ansøgernes kvalifikationer vil ansættelserne blive som ph.d. studerende, post doc. eller lektor.

MikroRNA i blod som markør til tidlig detektion af colorektal cancer.

I Danmark diagnosticeres ca. 3600 nye tilfælde af colorektal cancer hvert år. Mere end halvdelen af disse er fremskredne cancere som allerede har metastatisk spredning på diagnosetidspunktet. Selv efter kirurgisk og onkologisk behandling er den gennemsnitlige 5 års overlevelse for disse patienter mindre end 50%.

Dette står i skærende kontrast til hvis sygdommen diagnosticeres i de tidlige stadier, hvor 5 års overlevelsen nærmer sig de 90 %. Hvis den samlede overlevelse af colorektal cancer skal forbedres, er det altså afgørende, at diagnosticere sygdommen tidligere, måske endda på et tidspunkt hvor patienterne endnu ikke har symptomer.
Studier af blodprøver fra kræftpatienter viser, at kræftrelaterede miRNAer kan detekteres allerede tidligt i sygdomsudviklingen. Formålet med dette projekt er at identificere miRNA'er, hvis transkriptniveau i blodprøver kan benyttes som diagnostiske markører i forbindelse med screening af individer uden symptomer på colorektal cancer.  
Projektlederen skal bl.a. stå for implementering af metoder til oprensning af miRNA fra plasma og til high-throughput måling af miRNAer i sådanne RNA præparationer. Projektlederen skal ligeledes varetage udvælgelsen af relevante prøver fra biobanken, og stå for analysen af disse med ovenstående metoder. Bliver der i forbindelse med projektet behov for indsamling af yderligere prøver f.eks. kontrolpatienter med andre benigne tarmlidelser, så skal projektlederen udarbejde protokoller til indsamling af disse, samt sørge for, at disse bliver anmeldt og godkendt af videnskabsetisk komité. Projektlederen skal analysere de data der genereres og udarbejde manuskripter til publikation.

Molekylære markører til forudsigelse af XELOX behandlingsrespons hos patienter med metastatiske colorektal cancer

Dette projekt søger at løse et at de store problemer med kemoterapi behandlingen af metastatisk colorektal cancer, nemlig at en stor andel af de behandlede patienter ikke har gavn af behandlingen, men til gengæld oftest oplever betydelige bivirkninger.
En måde at forbedre effekten af de nuværende kemoterapeutika er at udvikle biomarkører, der kan forudsige behandlingsrespons. Onkologerne vil kunne anvende disse markører til at analysere den enkelte kræftpatients tumor, og dermed bedre kunne afgøre, hvilken kemobehandling der har størst sandsynlighed for at være effektfuld. Denne tilgang vil både kunne forbedre patienternes overlevelse og forøge patienternes livskvalitet. Derudover, vil samfundet samtidig spare de betydelige økonomiske resourser der i dag anvendes på uvirksomme behandlinger.
Planen med projektet er initielt at screene for epigenetisk, genetiske, og transcriptionelle (mRNA og miRNA) forskelle i primær tumorvæv fra metastatiske colorektal cancer patienter der enten responderede (n=50) eller ikke-responderede (n=50) på XELOX behandling. Lovende biomarkører fra den initielle screening vil efterfølgende blive afprøvet enkeltvis på større uafhængige patientkohorter. Der er tale om et tværfagligt samarbejdsprojekt, hvor patientmaterialet, de patologiske og kliniske oplysninger leveres af flere forskellige afdelinger.  

Afhængigt af erfaringer vil projektlederen enten selvstændigt eller i samarbejde med gruppens øvrige forskere stå for screeningsanalyserne af vævet. Projektlederen skal ligeledes stå for afprøvning af lovende biomarkører identificeret i screeningerne i uafhængige patientkohorter, herunder udvikling af egnede assays. Derudover skal projektlederen  bl.a. stå for at organisere indsamlingen af patientmaterialet samt registrering af de patologiske og kliniske oplysninger i relevante databaser. I samarbejde med projektets patolog  har projektlederen også ansvaret for at vurdere egnetheden af det indsamlede væv, samt for at koordinere oprensning af RNA og DNA fra materialet. Projektlederen skal analysere data og udarbejde manuskripter til publikation.